Criado com o objetivo de estimular o interesse de todos os alunos, da Educação Pré-Escolar ao Ensino Básico e Secundário, na partilha do conhecimento e na cultura científica através do apoio a projetos multidisciplinares e inovadores nas áreas da ciência e da tecnologia, o Prémio Ciência na Escola, da Fundação Ilídio Pinho e do Ministério da Educação.

O prémio distingue projetos multidisciplinares nas áreas da ciência e da tecnologia, desenvolvidos em contexto escolar, de caráter eminentemente prático, mobilizando as várias áreas curriculares para o seu desenvolvimento e que envolvam os alunos em experiências e trabalhos de grupo, que lhes permita reconhecer a importância do conhecimento e do método científico no seu percurso; futuro, e que se distingam pela criatividade, inovação e impacto social e económico.

Mercê da participação anterior do AEPAL com projetos distinguidos, o PCE pode funcionar como elemento agregador e, sobretudo, potenciar a transversalidade e articulação entre micro-projetos e projetos curriculares entre várias turmas do agrupamento.